Antibiotika působí proti citlivým bakteriím, nikoli proti virům nebo roztočům. Jejich použití ve včelařství podléhá přísným pravidlům a v řadě případů není povoleno. Nevhodná aplikace může zanechat rezidua v medu a podporovat rezistenci. Bakteriální nákazy je nutné řešit podle veterinárních předpisů.